dipimpin oleh Dr. Ir. Sri Rachmania Juliastuti, M. Eng sebagai kepala laboratorium. Laboratorium ini bergerak dalam wilayah pengolahan limbah industri baik secara pengolahan biologis maupun secara fisik dan kimia. Adapun Penelitian unggulan yang dilakukan:

• Study Tentang Pengaruh Inhibitor terhadap Laju Pertumbuhan Specifik Maksimum Denitrifikasi pada Proses Lumpur Aktif.
• Pengolahan Limbah Lumpur aktif secara anaerobik dengan jaringan syaraf tiruan dan pemanfaatan gas bio sebagai substitusi energi.
• Penurunan Kadar Ammonia Limbah Cair PT Petrokimia dengan Menggunakan Membran Cair Kerosene dengan jenis Surfaktan SPAN 80.
• Kajian kinerja Dissolved Air Flotation (DAF) sistem kontinu terhadap penurunan kadar minyak dan COD Limbah Pertamina DOH Jawa Bagian Barat-Balongan
•  Pembuatan biogas dari sludge
• Studi Penghilangan warna Limbah Cair Industri Tekstil dengan menggunakan Alum, PAC atau MgCl2.
• Removal siloxane dalam biogas dengan adsorber karbon aktif
• Pengaruh H2O2 terhadap Pengolahan Limbah Formaldehid secara Biologis Aerobik
• Study kinerja Dissolved Air Flotation terhadap penurunan kandungan minyak pada air limbah.
• Adsorbsi Logam Berat Limbah Elektroplating dengan kulit udang
• Pembuatan Biogas dari kotoran Sapi secara Anaerobik.
• Klorinasi Limbah Berminyak