Proses pengunduran diri mahasiswa di ITS dilakukan secara online melalui akun MyITS. Mahasiswa mengajukan permohonan melalui layanan surat, kemudian mendownload formulir hasil pengajuan. Formulir tersebut ditandatangani dengan materai serta memperoleh tanda tangan Orang Tua dan Kepala Departemen, lalu diserahkan ke Tata Usaha Departemen untuk diverifikasi dan discan. File hasil scanning diteruskan ke Fakultas, diolah oleh Petugas Akademik, diberi agenda, ditandatangani Dekan, dan distempel. Formulir permohonan kemudian dikirim melalui MyITS ke Wakil Rektor I dengan tembusan ke Direktorat Pendidikan (untuk program Sarjana) atau Direktorat Pascasarjana (untuk program Pascasarjana) serta ke Departemen terkait. Setelah WR I menerima dan mendisposisikan permohonan, Direktorat terkait membuat Surat Keterangan Pengunduran Diri yang ditandatangani WR I. Surat keterangan ini selanjutnya dikirim kembali ke mahasiswa, Departemen, dan Fakultas melalui MyITS, menandai selesainya seluruh proses pengunduran diri.